Family IRES_c-sis
Download the aligments for this family. (.stk)
RNA Shape
Level1
((((((((((((((()))))(((())))))))((()))))))))()(((((((()((()))(((((((())())))))))))))(((())))))(())
Level2
((()())())()((()()(()()))())()
Consensus Secondary Structure representation
>predicted reference IRES_c-sis
CGGAGCAGCCGCGGCUCGCAGCUCGCAGCUCGCAGCCCGCAGAGGACGCCCAGAGCGGCGAGCGGGCGGGCAGACGGACCGACGGACUCGCGCCGCGUCCACCCGUCGGCCGGGCCCAGCCGAGCGCGCAGCGGGCACGCCGCGCGCGCGGAGCAGCCGUGCCCGCCGCCCGGGCCCGCCGCCAGGGCGCACACGCUCCCGCCCCCCUACCCGGCCCGGGCGGGAGCUUGCACCUCUCCCUGCCCGGGUGCUCGAGCCGCCGCUGCAAAGCCAACUUUGGAAAAAGUUUUUUGGGGGAGACCUGGGCCUUGAGGUGCCCAGCUCCGCGCUUUCCGAUUUUGGGGGCCUUUCCAGAAAAUGUUGCAAAAAAGCUAAGCCGGCGGGCAGAGGAAAACGCCUGCAGCCGGCGAGCGAAGACGAACCACCGACUGCCGUGUUCCUCCUCCUCUUGGAGGUUGGAGCCCCCUGGGCGCCCCCACACGGCUAGACGCCUCGGCUGGUUCGCGACGCAGCCCCCCGGCCGCGGAUGCGCACCCGGGCUCGGGAUCCGCCCAGGCAGCGGCCUCGGACCCAGGCCCUGCGCCCAGGUCCUCCCCCGCCCCCCAGCGACGGAGCCGGGGC
.((.(((((.((((((((.(((................(.(((((.(((((.(.((((((.((.(((((((...(((.(((((((...(((...))).....)))))))))).)))).)))...((.((.(((((((((((((....))))......))))))))).)).)).)).))))))).)))))..((.((((((((((.((.....))...)))))))))).))..))))).)..........))))))))))).)))))....)).(((((....))))).....(((((((((((((((.....(((((...((((((((....(((.....((((((................((......))...((((((..((((.(.....)..)))).))))))..(((..(.(((((((((((((((((((((((.(((((....)))))..)))((((...))))......))))))).)).....)))).))))))))..))).))))))))).)))))).))))))).((((..(((.((((...((((....)))))))))))..))))...)))))))).)))))))...((((.((......)).)))).