 ==> Time started 06/01/2020, 15:38:03

 ==> Command line: /home/rnamasonry/rnamasonry/rnamasonry.sh --project_dir rms_input_fa --webservice -i input.fa --steps 100


 ==> Created new project dir at rms_input_fa

 --> Extracting RNA motifs
      Found 4 loops, 4 stems and 1 single stranded fragments
 --> Preparing data for node [  0]
       0% |                       | ETA:  --:--:--
       1% |                       | ETA:  00:00:03
       2% |                       | ETA:  00:00:04
       3% |                       | ETA:  00:00:12
       4% |                       | ETA:  00:00:14
       5% |#                      | ETA:  00:00:14
       6% |#                      | ETA:  00:00:16
       7% |#                      | ETA:  00:00:17
       8% |#                      | ETA:  00:00:17
       9% |##                     | ETA:  00:00:16
      10% |##                     | ETA:  00:00:18
      11% |##                     | ETA:  00:00:18
      12% |##                     | ETA:  00:00:18
      13% |###                    | ETA:  00:00:18
      14% |###                    | ETA:  00:00:18
      15% |###                    | ETA:  00:00:17
      16% |###                    | ETA:  00:00:17
      17% |###                    | ETA:  00:00:16
      18% |####                   | ETA:  00:00:15
      19% |####                   | ETA:  00:00:14
      20% |####                   | ETA:  00:00:13
      21% |####                   | ETA:  00:00:12
      22% |#####                  | ETA:  00:00:11
      23% |#####                  | ETA:  00:00:11
      24% |#####                  | ETA:  00:00:10
      25% |#####                  | ETA:  00:00:09
      26% |#####                  | ETA:  00:00:09
      27% |######                 | ETA:  00:00:08
      28% |######                 | ETA:  00:00:08
      29% |######                 | ETA:  00:00:08
      30% |######                 | ETA:  00:00:07
      31% |#######                | ETA:  00:00:07
      32% |#######                | ETA:  00:00:07
      33% |#######                | ETA:  00:00:06
      34% |#######                | ETA:  00:00:06
      35% |########               | ETA:  00:00:06
      36% |########               | ETA:  00:00:05
      37% |########               | ETA:  00:00:05
      38% |########               | ETA:  00:00:05
      39% |########               | ETA:  00:00:05
      40% |#########              | ETA:  00:00:04
      41% |#########              | ETA:  00:00:04
      42% |#########              | ETA:  00:00:04
      43% |#########              | ETA:  00:00:04
      44% |##########             | ETA:  00:00:04
      45% |##########             | ETA:  00:00:04
      46% |##########             | ETA:  00:00:03
      47% |##########             | ETA:  00:00:03
      48% |###########            | ETA:  00:00:03
      49% |###########            | ETA:  00:00:03
      50% |###########            | ETA:  00:00:03
      51% |###########            | ETA:  00:00:03
      52% |###########            | ETA:  00:00:03
      53% |############           | ETA:  00:00:02
      54% |############           | ETA:  00:00:02
      55% |############           | ETA:  00:00:02
      56% |############           | ETA:  00:00:02
      57% |#############          | ETA:  00:00:02
      58% |#############          | ETA:  00:00:02
      59% |#############          | ETA:  00:00:02
      60% |#############          | ETA:  00:00:02
      61% |##############         | ETA:  00:00:02
      62% |##############         | ETA:  00:00:02
      63% |##############         | ETA:  00:00:01
      64% |##############         | ETA:  00:00:01
      65% |##############         | ETA:  00:00:01
      66% |###############        | ETA:  00:00:01
      67% |###############        | ETA:  00:00:01
      68% |###############        | ETA:  00:00:01
      69% |###############        | ETA:  00:00:01
      70% |################       | ETA:  00:00:01
      71% |################       | ETA:  00:00:01
      72% |################       | ETA:  00:00:01
      73% |################       | ETA:  00:00:01
      74% |#################      | ETA:  00:00:01
      75% |#################      | ETA:  00:00:01
      76% |#################      | ETA:  00:00:01
      77% |#################      | ETA:  00:00:00
      78% |#################      | ETA:  00:00:00
      79% |##################     | ETA:  00:00:00
      80% |##################     | ETA:  00:00:00
      81% |##################     | ETA:  00:00:00
      82% |##################     | ETA:  00:00:00
      83% |###################    | ETA:  00:00:00
      84% |###################    | ETA:  00:00:00
      85% |###################    | ETA:  00:00:00
      86% |###################    | ETA:  00:00:00
      87% |####################   | ETA:  00:00:00
      88% |####################   | ETA:  00:00:00
      89% |####################   | ETA:  00:00:00
      90% |####################   | ETA:  00:00:00
      91% |####################   | ETA:  00:00:00
      92% |#####################  | ETA:  00:00:00
      93% |#####################  | ETA:  00:00:00
      94% |#####################  | ETA:  00:00:00
      95% |#####################  | ETA:  00:00:00
      96% |###################### | ETA:  00:00:00
      97% |###################### | ETA:  00:00:00
      98% |###################### | ETA:  00:00:00
      99% |###################### | ETA:  00:00:00
     100% |#######################| Time: 00:00:03
 --> Preparing data for node [  1]
       0% |                       | ETA:  --:--:--
       1% |                       | ETA:  00:00:01
       2% |                       | ETA:  00:00:02
       3% |                       | ETA:  00:00:02
       4% |                       | ETA:  00:00:02
       5% |#                      | ETA:  00:00:03
       6% |#                      | ETA:  00:00:04
       7% |#                      | ETA:  00:00:04
       8% |#                      | ETA:  00:00:04
       9% |##                     | ETA:  00:00:04
      10% |##                     | ETA:  00:00:04
      11% |##                     | ETA:  00:00:04
      12% |##                     | ETA:  00:00:04
      13% |###                    | ETA:  00:00:04
      14% |###                    | ETA:  00:00:04
      15% |###                    | ETA:  00:00:04
      16% |###                    | ETA:  00:00:04
      17% |####                   | ETA:  00:00:03
      18% |####                   | ETA:  00:00:03
      19% |####                   | ETA:  00:00:04
      20% |####                   | ETA:  00:00:04
      21% |####                   | ETA:  00:00:04
      22% |#####                  | ETA:  00:00:03
      23% |#####                  | ETA:  00:00:03
      24% |#####                  | ETA:  00:00:03
      25% |#####                  | ETA:  00:00:03
      26% |######                 | ETA:  00:00:03
      27% |######                 | ETA:  00:00:03
      28% |######                 | ETA:  00:00:03
      29% |######                 | ETA:  00:00:03
      30% |######                 | ETA:  00:00:03
      31% |#######                | ETA:  00:00:03
      32% |#######                | ETA:  00:00:02
      33% |#######                | ETA:  00:00:02
      34% |#######                | ETA:  00:00:02
      35% |########               | ETA:  00:00:02
      36% |########               | ETA:  00:00:02
      37% |########               | ETA:  00:00:02
      38% |########               | ETA:  00:00:02
      39% |#########              | ETA:  00:00:02
      40% |#########              | ETA:  00:00:02
      41% |#########              | ETA:  00:00:02
      42% |#########              | ETA:  00:00:02
      43% |#########              | ETA:  00:00:02
      44% |##########             | ETA:  00:00:02
      45% |##########             | ETA:  00:00:02
      46% |##########             | ETA:  00:00:02
      47% |##########             | ETA:  00:00:02
      48% |###########            | ETA:  00:00:02
      49% |###########            | ETA:  00:00:02
      50% |###########            | ETA:  00:00:02
      51% |###########            | ETA:  00:00:02
      52% |###########            | ETA:  00:00:02
      53% |############           | ETA:  00:00:02
      54% |############           | ETA:  00:00:02
      55% |############           | ETA:  00:00:02
      56% |############           | ETA:  00:00:01
      57% |#############          | ETA:  00:00:01
      58% |#############          | ETA:  00:00:01
      59% |#############          | ETA:  00:00:01
      60% |#############          | ETA:  00:00:01
      61% |##############         | ETA:  00:00:01
      62% |##############         | ETA:  00:00:01
      63% |##############         | ETA:  00:00:01
      64% |##############         | ETA:  00:00:01
      65% |###############        | ETA:  00:00:01
      66% |###############        | ETA:  00:00:01
      67% |###############        | ETA:  00:00:01
      68% |###############        | ETA:  00:00:01
      69% |################       | ETA:  00:00:01
      70% |################       | ETA:  00:00:01
      71% |################       | ETA:  00:00:01
      72% |################       | ETA:  00:00:01
      73% |################       | ETA:  00:00:01
      74% |#################      | ETA:  00:00:01
      75% |#################      | ETA:  00:00:01
      76% |#################      | ETA:  00:00:01
      77% |#################      | ETA:  00:00:00
      78% |##################     | ETA:  00:00:00
      79% |##################     | ETA:  00:00:00
      80% |##################     | ETA:  00:00:00
      81% |##################     | ETA:  00:00:00
      82% |##################     | ETA:  00:00:00
      83% |###################    | ETA:  00:00:00
      84% |###################    | ETA:  00:00:00
      85% |###################    | ETA:  00:00:00
      86% |###################    | ETA:  00:00:00
      87% |####################   | ETA:  00:00:00
      88% |####################   | ETA:  00:00:00
      89% |####################   | ETA:  00:00:00
      90% |####################   | ETA:  00:00:00
      91% |####################   | ETA:  00:00:00
      92% |#####################  | ETA:  00:00:00
      93% |#####################  | ETA:  00:00:00
      94% |#####################  | ETA:  00:00:00
      95% |#####################  | ETA:  00:00:00
      96% |###################### | ETA:  00:00:00
      97% |###################### | ETA:  00:00:00
      98% |###################### | ETA:  00:00:00
      99% |###################### | ETA:  00:00:00
     100% |#######################| Time: 00:00:04
 --> Preparing data for node [  2]
       0% |                       | ETA:  --:--:--
       1% |                       | ETA:  00:00:03
       2% |                       | ETA:  00:00:07
       3% |                       | ETA:  00:00:13
       4% |                       | ETA:  00:00:14
       5% |#                      | ETA:  00:00:15
       6% |#                      | ETA:  00:00:16
       7% |#                      | ETA:  00:00:20
       8% |#                      | ETA:  00:00:22
       9% |##                     | ETA:  00:00:23
      10% |##                     | ETA:  00:00:22
      11% |##                     | ETA:  00:00:25
      12% |##                     | ETA:  00:00:25
      13% |###                    | ETA:  00:00:27
      14% |###                    | ETA:  00:00:28
      15% |###                    | ETA:  00:00:25
      16% |###                    | ETA:  00:00:23
      17% |###                    | ETA:  00:00:22
      18% |####                   | ETA:  00:00:20
      19% |####                   | ETA:  00:00:19
      20% |####                   | ETA:  00:00:18
      21% |####                   | ETA:  00:00:17
      22% |#####                  | ETA:  00:00:16
      23% |#####                  | ETA:  00:00:15
      24% |#####                  | ETA:  00:00:14
      25% |#####                  | ETA:  00:00:13
      26% |######                 | ETA:  00:00:12
      27% |######                 | ETA:  00:00:12
      28% |######                 | ETA:  00:00:11
      29% |######                 | ETA:  00:00:11
      30% |######                 | ETA:  00:00:10
      31% |#######                | ETA:  00:00:10
      32% |#######                | ETA:  00:00:09
      33% |#######                | ETA:  00:00:09
      34% |#######                | ETA:  00:00:08
      35% |########               | ETA:  00:00:08
      36% |########               | ETA:  00:00:08
      37% |########               | ETA:  00:00:07
      38% |########               | ETA:  00:00:07
      39% |########               | ETA:  00:00:07
      40% |#########              | ETA:  00:00:06
      41% |#########              | ETA:  00:00:06
      42% |#########              | ETA:  00:00:06
      43% |#########              | ETA:  00:00:06
      44% |##########             | ETA:  00:00:05
      45% |##########             | ETA:  00:00:05
      46% |##########             | ETA:  00:00:05
      47% |##########             | ETA:  00:00:05
      48% |###########            | ETA:  00:00:04
      49% |###########            | ETA:  00:00:04
      50% |###########            | ETA:  00:00:04
      51% |###########            | ETA:  00:00:04
      52% |###########            | ETA:  00:00:04
      53% |############           | ETA:  00:00:04
      54% |############           | ETA:  00:00:03
      55% |############           | ETA:  00:00:03
      56% |############           | ETA:  00:00:03
      57% |#############          | ETA:  00:00:03
      58% |#############          | ETA:  00:00:03
      59% |#############          | ETA:  00:00:03
      60% |#############          | ETA:  00:00:03
      61% |##############         | ETA:  00:00:02
      62% |##############         | ETA:  00:00:02
      63% |##############         | ETA:  00:00:02
      64% |##############         | ETA:  00:00:02
      65% |##############         | ETA:  00:00:02
      66% |###############        | ETA:  00:00:02
      67% |###############        | ETA:  00:00:02
      68% |###############        | ETA:  00:00:02
      69% |###############        | ETA:  00:00:02
      70% |################       | ETA:  00:00:01
      71% |################       | ETA:  00:00:01
      72% |################       | ETA:  00:00:01
      73% |################       | ETA:  00:00:01
      74% |#################      | ETA:  00:00:01
      75% |#################      | ETA:  00:00:01
      76% |#################      | ETA:  00:00:01
      77% |#################      | ETA:  00:00:01
      78% |#################      | ETA:  00:00:01
      79% |##################     | ETA:  00:00:01
      80% |##################     | ETA:  00:00:01
      81% |##################     | ETA:  00:00:01
      82% |##################     | ETA:  00:00:01
      83% |###################    | ETA:  00:00:00
      84% |###################    | ETA:  00:00:00
      85% |###################    | ETA:  00:00:00
      86% |###################    | ETA:  00:00:00
      87% |####################   | ETA:  00:00:00
      88% |####################   | ETA:  00:00:00
      89% |####################   | ETA:  00:00:00
      90% |####################   | ETA:  00:00:00
      91% |####################   | ETA:  00:00:00
      92% |#####################  | ETA:  00:00:00
      93% |#####################  | ETA:  00:00:00
      94% |#####################  | ETA:  00:00:00
      95% |#####################  | ETA:  00:00:00
      96% |###################### | ETA:  00:00:00
      97% |###################### | ETA:  00:00:00
      98% |###################### | ETA:  00:00:00
      99% |###################### | ETA:  00:00:00
     100% |#######################| Time: 00:00:04
 --> Preparing data for node [  3]
       0% |                       | ETA:  --:--:--
       1% |                       | ETA:  00:00:03
       2% |                       | ETA:  00:00:13
       3% |                       | ETA:  00:00:16
       4% |                       | ETA:  00:00:20
       5% |#                      | ETA:  00:00:26
       6% |#                      | ETA:  00:00:26
       7% |#                      | ETA:  00:00:28
       8% |#                      | ETA:  00:00:31
       9% |##                     | ETA:  00:00:32
      10% |##                     | ETA:  00:00:33
      11% |##                     | ETA:  00:00:33
      12% |##                     | ETA:  00:00:33
      13% |###                    | ETA:  00:00:34
      14% |###                    | ETA:  00:00:33
      15% |###                    | ETA:  00:00:33
      16% |###                    | ETA:  00:00:32
      17% |###                    | ETA:  00:00:32
      18% |####                   | ETA:  00:00:32
      19% |####                   | ETA:  00:00:32
      20% |####                   | ETA:  00:00:32
      21% |####                   | ETA:  00:00:31
      22% |#####                  | ETA:  00:00:30
      23% |#####                  | ETA:  00:00:30
      24% |#####                  | ETA:  00:00:29
      25% |#####                  | ETA:  00:00:28
      26% |######                 | ETA:  00:00:27
      27% |######                 | ETA:  00:00:27
      28% |######                 | ETA:  00:00:26
      29% |######                 | ETA:  00:00:25
      30% |######                 | ETA:  00:00:25
      31% |#######                | ETA:  00:00:24
      32% |#######                | ETA:  00:00:23
      33% |#######                | ETA:  00:00:23
      34% |#######                | ETA:  00:00:22
      35% |########               | ETA:  00:00:22
      36% |########               | ETA:  00:00:21
      37% |########               | ETA:  00:00:21
      38% |########               | ETA:  00:00:21
      39% |########               | ETA:  00:00:21
      40% |#########              | ETA:  00:00:20
      41% |#########              | ETA:  00:00:20
      42% |#########              | ETA:  00:00:19
      43% |#########              | ETA:  00:00:19
      44% |##########             | ETA:  00:00:19
      45% |##########             | ETA:  00:00:19
      46% |##########             | ETA:  00:00:18
      47% |##########             | ETA:  00:00:18
      48% |###########            | ETA:  00:00:17
      49% |###########            | ETA:  00:00:17
      50% |###########            | ETA:  00:00:17
      51% |###########            | ETA:  00:00:16
      52% |###########            | ETA:  00:00:16
      53% |############           | ETA:  00:00:15
      54% |############           | ETA:  00:00:15
      55% |############           | ETA:  00:00:15
      56% |############           | ETA:  00:00:14
      57% |#############          | ETA:  00:00:14
      58% |#############          | ETA:  00:00:14
      59% |#############          | ETA:  00:00:14
      60% |#############          | ETA:  00:00:13
      61% |##############         | ETA:  00:00:13
      62% |##############         | ETA:  00:00:12
      63% |##############         | ETA:  00:00:12
      64% |##############         | ETA:  00:00:11
      65% |##############         | ETA:  00:00:11
      66% |###############        | ETA:  00:00:11
      67% |###############        | ETA:  00:00:10
      68% |###############        | ETA:  00:00:10
      69% |###############        | ETA:  00:00:10
      70% |################       | ETA:  00:00:09
      71% |################       | ETA:  00:00:09
      72% |################       | ETA:  00:00:09
      73% |################       | ETA:  00:00:08
      74% |#################      | ETA:  00:00:08
      75% |#################      | ETA:  00:00:08
      76% |#################      | ETA:  00:00:07
      77% |#################      | ETA:  00:00:07
      78% |#################      | ETA:  00:00:07
      79% |##################     | ETA:  00:00:07
      80% |##################     | ETA:  00:00:06
      81% |##################     | ETA:  00:00:06
      82% |##################     | ETA:  00:00:06
      83% |###################    | ETA:  00:00:05
      84% |###################    | ETA:  00:00:05
      85% |###################    | ETA:  00:00:05
      86% |###################    | ETA:  00:00:04
      87% |####################   | ETA:  00:00:04
      88% |####################   | ETA:  00:00:04
      89% |####################   | ETA:  00:00:03
      90% |####################   | ETA:  00:00:03
      91% |####################   | ETA:  00:00:03
      92% |#####################  | ETA:  00:00:02
      93% |#####################  | ETA:  00:00:02
      94% |#####################  | ETA:  00:00:02
      95% |#####################  | ETA:  00:00:01
      96% |###################### | ETA:  00:00:01
      97% |###################### | ETA:  00:00:00
      98% |###################### | ETA:  00:00:00
      99% |###################### | ETA:  00:00:00
     100% |#######################| Time: 00:00:33
 --> Preparing data for node [  4]
       0% |                       | ETA:  --:--:--
       1% |                       | ETA:  00:00:03
       2% |                       | ETA:  00:00:08
       3% |                       | ETA:  00:00:13
       4% |                       | ETA:  00:00:15
       5% |#                      | ETA:  00:00:18
       6% |#                      | ETA:  00:00:19
       7% |#                      | ETA:  00:00:23
       8% |#                      | ETA:  00:00:24
       9% |##                     | ETA:  00:00:24
      10% |##                     | ETA:  00:00:23
      11% |##                     | ETA:  00:00:23
      12% |##                     | ETA:  00:00:23
      13% |###                    | ETA:  00:00:23
      14% |###                    | ETA:  00:00:22
      15% |###                    | ETA:  00:00:20
      16% |###                    | ETA:  00:00:19
      17% |###                    | ETA:  00:00:18
      18% |####                   | ETA:  00:00:16
      19% |####                   | ETA:  00:00:15
      20% |####                   | ETA:  00:00:14
      21% |####                   | ETA:  00:00:14
      22% |#####                  | ETA:  00:00:13
      23% |#####                  | ETA:  00:00:12
      24% |#####                  | ETA:  00:00:11
      25% |#####                  | ETA:  00:00:11
      26% |######                 | ETA:  00:00:10
      27% |######                 | ETA:  00:00:10
      28% |######                 | ETA:  00:00:09
      29% |######                 | ETA:  00:00:09
      30% |######                 | ETA:  00:00:08
      31% |#######                | ETA:  00:00:08
      32% |#######                | ETA:  00:00:07
      33% |#######                | ETA:  00:00:07
      34% |#######                | ETA:  00:00:07
      35% |########               | ETA:  00:00:06
      36% |########               | ETA:  00:00:06
      37% |########               | ETA:  00:00:06
      38% |########               | ETA:  00:00:06
      39% |########               | ETA:  00:00:05
      40% |#########              | ETA:  00:00:05
      41% |#########              | ETA:  00:00:05
      42% |#########              | ETA:  00:00:05
      43% |#########              | ETA:  00:00:04
      44% |##########             | ETA:  00:00:04
      45% |##########             | ETA:  00:00:04
      46% |##########             | ETA:  00:00:04
      47% |##########             | ETA:  00:00:04
      48% |###########            | ETA:  00:00:04
      49% |###########            | ETA:  00:00:03
      50% |###########            | ETA:  00:00:03
      51% |###########            | ETA:  00:00:03
      52% |###########            | ETA:  00:00:03
      53% |############           | ETA:  00:00:03
      54% |############           | ETA:  00:00:03
      55% |############           | ETA:  00:00:03
      56% |############           | ETA:  00:00:02
      57% |#############          | ETA:  00:00:02
      58% |#############          | ETA:  00:00:02
      59% |#############          | ETA:  00:00:02
      60% |#############          | ETA:  00:00:02
      61% |##############         | ETA:  00:00:02
      62% |##############         | ETA:  00:00:02
      63% |##############         | ETA:  00:00:02
      64% |##############         | ETA:  00:00:02
      65% |##############         | ETA:  00:00:02
      66% |###############        | ETA:  00:00:01
      67% |###############        | ETA:  00:00:01
      68% |###############        | ETA:  00:00:01
      69% |###############        | ETA:  00:00:01
      70% |################       | ETA:  00:00:01
      71% |################       | ETA:  00:00:01
      72% |################       | ETA:  00:00:01
      73% |################       | ETA:  00:00:01
      74% |#################      | ETA:  00:00:01
      75% |#################      | ETA:  00:00:01
      76% |#################      | ETA:  00:00:01
      77% |#################      | ETA:  00:00:01
      78% |#################      | ETA:  00:00:01
      79% |##################     | ETA:  00:00:00
      80% |##################     | ETA:  00:00:00
      81% |##################     | ETA:  00:00:00
      82% |##################     | ETA:  00:00:00
      83% |###################    | ETA:  00:00:00
      84% |###################    | ETA:  00:00:00
      85% |###################    | ETA:  00:00:00
      86% |###################    | ETA:  00:00:00
      87% |####################   | ETA:  00:00:00
      88% |####################   | ETA:  00:00:00
      89% |####################   | ETA:  00:00:00
      90% |####################   | ETA:  00:00:00
      91% |####################   | ETA:  00:00:00
      92% |#####################  | ETA:  00:00:00
      93% |#####################  | ETA:  00:00:00
      94% |#####################  | ETA:  00:00:00
      95% |#####################  | ETA:  00:00:00
      96% |###################### | ETA:  00:00:00
      97% |###################### | ETA:  00:00:00
      98% |###################### | ETA:  00:00:00
      99% |###################### | ETA:  00:00:00
     100% |#######################| Time: 00:00:03
 --> Preparing data for node [  5]
       0% |                       | ETA:  --:--:--
       1% |                       | ETA:  00:00:25
       2% |                       | ETA:  00:00:31
       3% |                       | ETA:  00:00:25
       4% |                       | ETA:  00:00:25
       5% |#                      | ETA:  00:00:33
       6% |#                      | ETA:  00:00:31
       7% |#                      | ETA:  00:00:33
       8% |#                      | ETA:  00:00:33
       9% |##                     | ETA:  00:00:32
      10% |##                     | ETA:  00:00:31
      11% |##                     | ETA:  00:00:31
      12% |##                     | ETA:  00:00:32
      13% |##                     | ETA:  00:00:32
      14% |###                    | ETA:  00:00:32
      15% |###                    | ETA:  00:00:33
      16% |###                    | ETA:  00:00:33
      17% |###                    | ETA:  00:00:32
      18% |####                   | ETA:  00:00:33
      19% |####                   | ETA:  00:00:33
      20% |####                   | ETA:  00:00:32
      21% |####                   | ETA:  00:00:31
      22% |#####                  | ETA:  00:00:30
      23% |#####                  | ETA:  00:00:29
      24% |#####                  | ETA:  00:00:29
      25% |#####                  | ETA:  00:00:29
      26% |#####                  | ETA:  00:00:28
      27% |######                 | ETA:  00:00:27
      28% |######                 | ETA:  00:00:27
      29% |######                 | ETA:  00:00:27
      30% |######                 | ETA:  00:00:26
      31% |#######                | ETA:  00:00:26
      32% |#######                | ETA:  00:00:25
      33% |#######                | ETA:  00:00:25
      34% |#######                | ETA:  00:00:24
      35% |########               | ETA:  00:00:23
      36% |########               | ETA:  00:00:23
      37% |########               | ETA:  00:00:22
      38% |########               | ETA:  00:00:22
      39% |########               | ETA:  00:00:22
      40% |#########              | ETA:  00:00:22
      41% |#########              | ETA:  00:00:22
      42% |#########              | ETA:  00:00:21
      43% |#########              | ETA:  00:00:21
      44% |##########             | ETA:  00:00:20
      45% |##########             | ETA:  00:00:20
      46% |##########             | ETA:  00:00:20
      47% |##########             | ETA:  00:00:19
      48% |###########            | ETA:  00:00:19
      49% |###########            | ETA:  00:00:18
      50% |###########            | ETA:  00:00:18
      51% |###########            | ETA:  00:00:17
      52% |###########            | ETA:  00:00:17
      53% |############           | ETA:  00:00:16
      54% |############           | ETA:  00:00:16
      55% |############           | ETA:  00:00:15
      56% |############           | ETA:  00:00:15
      57% |#############          | ETA:  00:00:14
      58% |#############          | ETA:  00:00:14
      59% |#############          | ETA:  00:00:13
      60% |#############          | ETA:  00:00:13
      61% |##############         | ETA:  00:00:13
      62% |##############         | ETA:  00:00:12
      63% |##############         | ETA:  00:00:12
      64% |##############         | ETA:  00:00:12
      65% |##############         | ETA:  00:00:11
      66% |###############        | ETA:  00:00:11
      67% |###############        | ETA:  00:00:10
      68% |###############        | ETA:  00:00:10
      69% |###############        | ETA:  00:00:10
      70% |################       | ETA:  00:00:09
      71% |################       | ETA:  00:00:09
      72% |################       | ETA:  00:00:09
      73% |################       | ETA:  00:00:08
      74% |#################      | ETA:  00:00:08
      75% |#################      | ETA:  00:00:08
      76% |#################      | ETA:  00:00:07
      77% |#################      | ETA:  00:00:07
      78% |#################      | ETA:  00:00:07
      79% |##################     | ETA:  00:00:06
      80% |##################     | ETA:  00:00:06
      81% |##################     | ETA:  00:00:06
      82% |##################     | ETA:  00:00:05
      83% |###################    | ETA:  00:00:05
      84% |###################    | ETA:  00:00:05
      85% |###################    | ETA:  00:00:04
      86% |###################    | ETA:  00:00:04
      87% |####################   | ETA:  00:00:04
      88% |####################   | ETA:  00:00:03
      89% |####################   | ETA:  00:00:03
      90% |####################   | ETA:  00:00:03
      91% |####################   | ETA:  00:00:02
      92% |#####################  | ETA:  00:00:02
      93% |#####################  | ETA:  00:00:02
      94% |#####################  | ETA:  00:00:01
      95% |#####################  | ETA:  00:00:01
      96% |###################### | ETA:  00:00:01
      97% |###################### | ETA:  00:00:00
      98% |###################### | ETA:  00:00:00
      99% |###################### | ETA:  00:00:00
     100% |#######################| Time: 00:00:31
 --> Preparing data for node [  6]
       0% |                       | ETA:  --:--:--
       1% |                       | ETA:  00:00:27
       2% |                       | ETA:  00:00:31
       3% |                       | ETA:  00:00:31
       4% |                       | ETA:  00:00:30
       5% |#                      | ETA:  00:00:28
       6% |#                      | ETA:  00:00:29
       7% |#                      | ETA:  00:00:27
       8% |#                      | ETA:  00:00:28
       9% |##                     | ETA:  00:00:27
      10% |##                     | ETA:  00:00:27
      11% |##                     | ETA:  00:00:29
      12% |##                     | ETA:  00:00:27
      13% |##                     | ETA:  00:00:27
      14% |###                    | ETA:  00:00:25
      15% |###                    | ETA:  00:00:23
      16% |###                    | ETA:  00:00:21
      17% |###                    | ETA:  00:00:20
      18% |####                   | ETA:  00:00:18
      19% |####                   | ETA:  00:00:17
      20% |####                   | ETA:  00:00:16
      21% |####                   | ETA:  00:00:15
      22% |#####                  | ETA:  00:00:14
      23% |#####                  | ETA:  00:00:13
      24% |#####                  | ETA:  00:00:13
      25% |#####                  | ETA:  00:00:12
      26% |#####                  | ETA:  00:00:11
      27% |######                 | ETA:  00:00:11
      28% |######                 | ETA:  00:00:10
      29% |######                 | ETA:  00:00:10
      30% |######                 | ETA:  00:00:09
      31% |#######                | ETA:  00:00:09
      32% |#######                | ETA:  00:00:08
      33% |#######                | ETA:  00:00:08
      34% |#######                | ETA:  00:00:08
      35% |########               | ETA:  00:00:07
      36% |########               | ETA:  00:00:07
      37% |########               | ETA:  00:00:07
      38% |########               | ETA:  00:00:06
      39% |########               | ETA:  00:00:06
      40% |#########              | ETA:  00:00:06
      41% |#########              | ETA:  00:00:05
      42% |#########              | ETA:  00:00:05
      43% |#########              | ETA:  00:00:05
      44% |##########             | ETA:  00:00:05
      45% |##########             | ETA:  00:00:05
      46% |##########             | ETA:  00:00:04
      47% |##########             | ETA:  00:00:04
      48% |###########            | ETA:  00:00:04
      49% |###########            | ETA:  00:00:04
      50% |###########            | ETA:  00:00:04
      51% |###########            | ETA:  00:00:03
      52% |###########            | ETA:  00:00:03
      53% |############           | ETA:  00:00:03
      54% |############           | ETA:  00:00:03
      55% |############           | ETA:  00:00:03
      56% |############           | ETA:  00:00:03
      57% |#############          | ETA:  00:00:03
      58% |#############          | ETA:  00:00:03
      59% |#############          | ETA:  00:00:02
      60% |#############          | ETA:  00:00:02
      61% |##############         | ETA:  00:00:02
      62% |##############         | ETA:  00:00:02
      63% |##############         | ETA:  00:00:02
      64% |##############         | ETA:  00:00:02
      65% |##############         | ETA:  00:00:02
      66% |###############        | ETA:  00:00:02
      67% |###############        | ETA:  00:00:02
      68% |###############        | ETA:  00:00:01
      69% |###############        | ETA:  00:00:01
      70% |################       | ETA:  00:00:01
      71% |################       | ETA:  00:00:01
      72% |################       | ETA:  00:00:01
      73% |################       | ETA:  00:00:01
      74% |#################      | ETA:  00:00:01
      75% |#################      | ETA:  00:00:01
      76% |#################      | ETA:  00:00:01
      77% |#################      | ETA:  00:00:01
      78% |#################      | ETA:  00:00:01
      79% |##################     | ETA:  00:00:01
      80% |##################     | ETA:  00:00:01
      81% |##################     | ETA:  00:00:00
      82% |##################     | ETA:  00:00:00
      83% |###################    | ETA:  00:00:00
      84% |###################    | ETA:  00:00:00
      85% |###################    | ETA:  00:00:00
      86% |###################    | ETA:  00:00:00
      87% |####################   | ETA:  00:00:00
      88% |####################   | ETA:  00:00:00
      89% |####################   | ETA:  00:00:00
      90% |####################   | ETA:  00:00:00
      91% |####################   | ETA:  00:00:00
      92% |#####################  | ETA:  00:00:00
      93% |#####################  | ETA:  00:00:00
      94% |#####################  | ETA:  00:00:00
      95% |#####################  | ETA:  00:00:00
      96% |###################### | ETA:  00:00:00
      97% |###################### | ETA:  00:00:00
      98% |###################### | ETA:  00:00:00
      99% |###################### | ETA:  00:00:00
     100% |#######################| Time: 00:00:04
 --> Preparing data for node [  7]
       0% |                       | ETA:  --:--:--
       1% |                       | ETA:  00:00:06
       2% |                       | ETA:  00:00:23
       3% |                       | ETA:  00:00:27
       4% |                       | ETA:  00:00:25
       5% |#                      | ETA:  00:00:27
       6% |#                      | ETA:  00:00:33
       7% |#                      | ETA:  00:00:32
       8% |#                      | ETA:  00:00:32
       9% |##                     | ETA:  00:00:32
      10% |##                     | ETA:  00:00:31
      11% |##                     | ETA:  00:00:31
      12% |##                     | ETA:  00:00:32
      13% |##                     | ETA:  00:00:34
      14% |###                    | ETA:  00:00:34
      15% |###                    | ETA:  00:00:34
      16% |###                    | ETA:  00:00:34
      17% |###                    | ETA:  00:00:33
      18% |####                   | ETA:  00:00:32
      19% |####                   | ETA:  00:00:32
      20% |####                   | ETA:  00:00:32
      21% |####                   | ETA:  00:00:32
      22% |#####                  | ETA:  00:00:31
      23% |#####                  | ETA:  00:00:31
      24% |#####                  | ETA:  00:00:31
      25% |#####                  | ETA:  00:00:31
      26% |#####                  | ETA:  00:00:30
      27% |######                 | ETA:  00:00:30
      28% |######                 | ETA:  00:00:29
      29% |######                 | ETA:  00:00:29
      30% |######                 | ETA:  00:00:28
      31% |#######                | ETA:  00:00:27
      32% |#######                | ETA:  00:00:26
      33% |#######                | ETA:  00:00:26
      34% |#######                | ETA:  00:00:26
      35% |########               | ETA:  00:00:25
      36% |########               | ETA:  00:00:24
      37% |########               | ETA:  00:00:24
      38% |########               | ETA:  00:00:23
      39% |########               | ETA:  00:00:22
      40% |#########              | ETA:  00:00:22
      41% |#########              | ETA:  00:00:22
      42% |#########              | ETA:  00:00:22
      43% |#########              | ETA:  00:00:21
      44% |##########             | ETA:  00:00:21
      45% |##########             | ETA:  00:00:21
      46% |##########             | ETA:  00:00:20
      47% |##########             | ETA:  00:00:20
      48% |###########            | ETA:  00:00:19
      49% |###########            | ETA:  00:00:19
      50% |###########            | ETA:  00:00:19
      51% |###########            | ETA:  00:00:18
      52% |###########            | ETA:  00:00:18
      53% |############           | ETA:  00:00:17
      54% |############           | ETA:  00:00:17
      55% |############           | ETA:  00:00:16
      56% |############           | ETA:  00:00:16
      57% |#############          | ETA:  00:00:15
      58% |#############          | ETA:  00:00:15
      59% |#############          | ETA:  00:00:14
      60% |#############          | ETA:  00:00:14
      61% |##############         | ETA:  00:00:13
      62% |##############         | ETA:  00:00:13
      63% |##############         | ETA:  00:00:13
      64% |##############         | ETA:  00:00:12
      65% |##############         | ETA:  00:00:12
      66% |###############        | ETA:  00:00:12
      67% |###############        | ETA:  00:00:11
      68% |###############        | ETA:  00:00:11
      69% |###############        | ETA:  00:00:10
      70% |################       | ETA:  00:00:10
      71% |################       | ETA:  00:00:10
      72% |################       | ETA:  00:00:09
      73% |################       | ETA:  00:00:09
      74% |#################      | ETA:  00:00:09
      75% |#################      | ETA:  00:00:08
      76% |#################      | ETA:  00:00:08
      77% |#################      | ETA:  00:00:08
      78% |#################      | ETA:  00:00:07
      79% |##################     | ETA:  00:00:07
      80% |##################     | ETA:  00:00:07
      81% |##################     | ETA:  00:00:06
      82% |##################     | ETA:  00:00:06
      83% |###################    | ETA:  00:00:06
      84% |###################    | ETA:  00:00:05
      85% |###################    | ETA:  00:00:05
      86% |###################    | ETA:  00:00:05
      87% |####################   | ETA:  00:00:04
      88% |####################   | ETA:  00:00:04
      89% |####################   | ETA:  00:00:04
      90% |####################   | ETA:  00:00:03
      91% |####################   | ETA:  00:00:03
      92% |#####################  | ETA:  00:00:02
      93% |#####################  | ETA:  00:00:02
      94% |#####################  | ETA:  00:00:02
      95% |#####################  | ETA:  00:00:01
      96% |###################### | ETA:  00:00:01
      97% |###################### | ETA:  00:00:01
      98% |###################### | ETA:  00:00:00
      99% |###################### | ETA:  00:00:00
     100% |#######################| Time: 00:00:36
 --> Preparing data for node [  8]
       0% |                       | ETA:  --:--:--
       1% |                       | ETA:  00:00:06
       2% |                       | ETA:  00:00:18
       3% |                       | ETA:  00:00:24
       4% |                       | ETA:  00:00:33
       5% |#                      | ETA:  00:00:38
       6% |#                      | ETA:  00:00:38
       7% |#                      | ETA:  00:00:38
       8% |#                      | ETA:  00:00:38
       9% |##                     | ETA:  00:00:37
      10% |##                     | ETA:  00:00:35
      11% |##                     | ETA:  00:00:35
      12% |##                     | ETA:  00:00:35
      13% |###                    | ETA:  00:00:36
      14% |###                    | ETA:  00:00:36
      15% |###                    | ETA:  00:00:35
      16% |###                    | ETA:  00:00:34
      17% |###                    | ETA:  00:00:33
      18% |####                   | ETA:  00:00:33
      19% |####                   | ETA:  00:00:32
      20% |####                   | ETA:  00:00:31
      21% |####                   | ETA:  00:00:30
      22% |#####                  | ETA:  00:00:30
      23% |#####                  | ETA:  00:00:28
      24% |#####                  | ETA:  00:00:27
      25% |#####                  | ETA:  00:00:26
      26% |#####                  | ETA:  00:00:26
      27% |######                 | ETA:  00:00:25
      28% |######                 | ETA:  00:00:24
      29% |######                 | ETA:  00:00:25
      30% |######                 | ETA:  00:00:24
      31% |#######                | ETA:  00:00:24
      32% |#######                | ETA:  00:00:23
      33% |#######                | ETA:  00:00:22
      34% |#######                | ETA:  00:00:22
      35% |########               | ETA:  00:00:22
      36% |########               | ETA:  00:00:22
      37% |########               | ETA:  00:00:22
      38% |########               | ETA:  00:00:21
      39% |########               | ETA:  00:00:21
      40% |#########              | ETA:  00:00:20
      41% |#########              | ETA:  00:00:20
      42% |#########              | ETA:  00:00:19
      43% |#########              | ETA:  00:00:19
      44% |##########             | ETA:  00:00:18
      45% |##########             | ETA:  00:00:18
      46% |##########             | ETA:  00:00:18
      47% |##########             | ETA:  00:00:18
      48% |###########            | ETA:  00:00:17
      49% |###########            | ETA:  00:00:17
      50% |###########            | ETA:  00:00:16
      51% |###########            | ETA:  00:00:16
      52% |###########            | ETA:  00:00:15
      53% |############           | ETA:  00:00:15
      54% |############           | ETA:  00:00:15
      55% |############           | ETA:  00:00:14
      56% |############           | ETA:  00:00:14
      57% |#############          | ETA:  00:00:13
      58% |#############          | ETA:  00:00:13
      59% |#############          | ETA:  00:00:12
      60% |#############          | ETA:  00:00:12
      61% |##############         | ETA:  00:00:12
      62% |##############         | ETA:  00:00:11
      63% |##############         | ETA:  00:00:11
      64% |##############         | ETA:  00:00:10
      65% |##############         | ETA:  00:00:10
      66% |###############        | ETA:  00:00:10
      67% |###############        | ETA:  00:00:09
      68% |###############        | ETA:  00:00:09
      69% |###############        | ETA:  00:00:09
      70% |################       | ETA:  00:00:08
      71% |################       | ETA:  00:00:08
      72% |################       | ETA:  00:00:08
      73% |################       | ETA:  00:00:08
      74% |#################      | ETA:  00:00:07
      75% |#################      | ETA:  00:00:07
      76% |#################      | ETA:  00:00:07
      77% |#################      | ETA:  00:00:06
      78% |#################      | ETA:  00:00:06
      79% |##################     | ETA:  00:00:06
      80% |##################     | ETA:  00:00:06
      81% |##################     | ETA:  00:00:05
      82% |##################     | ETA:  00:00:05
      83% |###################    | ETA:  00:00:05
      84% |###################    | ETA:  00:00:05
      85% |###################    | ETA:  00:00:04
      86% |###################    | ETA:  00:00:04
      87% |####################   | ETA:  00:00:04
      88% |####################   | ETA:  00:00:03
      89% |####################   | ETA:  00:00:03
      90% |####################   | ETA:  00:00:03
      91% |####################   | ETA:  00:00:02
      92% |#####################  | ETA:  00:00:02
      93% |#####################  | ETA:  00:00:02
      94% |#####################  | ETA:  00:00:01
      95% |#####################  | ETA:  00:00:01
      96% |###################### | ETA:  00:00:01
      97% |###################### | ETA:  00:00:00
      98% |###################### | ETA:  00:00:00
      99% |###################### | ETA:  00:00:00
     100% |#######################| Time: 00:00:31

 --> Node statistics
      Node 0 -     stem             7_7 [  100]
      Node 1 -     loop         4_3_7_2 [  125]
      Node 2 -     stem             4_4 [  100]
      Node 3 -     loop              10 [ 1056]
      Node 4 -     stem             4_4 [  100]
      Node 5 -     loop              11 [ 1050]
      Node 6 -     stem             5_5 [  100]
      Node 7 -     loop               9 [ 1257]
      Node 8 -   strand               5 [ 1130]


 --> Processing node: 8
 --> Processing node: 7
 --> Processing node: 6
 --> Processing node: 5
 --> Processing node: 4
 --> Processing node: 3
 --> Processing node: 2
 --> Processing node: 1
 --> Processing node: 0

 --> Found 1 starting structures with reasonable geometry

 --> Defined shelf temperatures:  1.00, 2.15, 4.64, 10.00
 --> [SimRNA3] Input sequence and secondary structure:

GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCA
..................(....................................)....................

 ==> Starting 100 folding steps

 --> STEP: 1


     10.00:    -572.80 
      4.64:    -517.43 
      2.15:    -602.33 
      1.00:    -589.36 



 --> STEP: 2


     10.00:    -538.01 |
      4.64:    -572.09 |
      2.15:    -611.29 |
      1.00:    -622.45 |



 --> STEP: 3


     10.00:    -552.80 
      4.64:    -584.43 
      2.15:    -614.05 
      1.00:    -626.25 



 --> STEP: 4


     10.00:    -585.08 
      4.64:    -603.34 
      2.15:    -609.79 
      1.00:    -628.76 



 --> STEP: 5


     10.00:    -563.99 
      4.64:    -593.96 
      2.15:    -612.12 
      1.00:    -643.09 



 --> STEP: 6


     10.00:    -590.44 |
      4.64:    -599.86 |
      2.15:    -618.41 
      1.00:    -643.09 



 --> STEP: 7


     10.00:    -596.35 
      4.64:    -599.88 
      2.15:    -619.26 
      1.00:    -640.91 



 --> STEP: 8


     10.00:    -590.02 
      4.64:    -600.36 
      2.15:    -619.26 
      1.00:    -640.86 



 --> STEP: 9


     10.00:    -580.78 
      4.64:    -607.89 
      2.15:    -619.26 
      1.00:    -642.64 



 --> STEP: 10


     10.00:    -612.05 
      4.64:    -616.95 
      2.15:    -628.82 
      1.00:    -642.64 



 --> STEP: 11


     10.00:    -576.35 
      4.64:    -617.82 
      2.15:    -633.66 
      1.00:    -642.64 



 --> STEP: 12


     10.00:    -587.43 |
      4.64:    -587.42 |
      2.15:    -633.66 
      1.00:    -642.64 



 --> STEP: 13


     10.00:    -535.16 
      4.64:    -577.16 
      2.15:    -632.76 
      1.00:    -642.64 



 --> STEP: 14


     10.00:    -602.36 |
      4.64:    -602.83 |
      2.15:    -632.76 
      1.00:    -642.64 



 --> STEP: 15


     10.00:    -554.53 
      4.64:    -604.38 
      2.15:    -635.43 
      1.00:    -642.64 



 --> STEP: 16


     10.00:    -570.24 
      4.64:    -610.05 
      2.15:    -637.23 
      1.00:    -644.81 



 --> STEP: 17


     10.00:    -595.63 
      4.64:    -615.59 
      2.15:    -634.60 
      1.00:    -644.19 



 --> STEP: 18


     10.00:    -570.63 
      4.64:    -646.59 
      2.15:    -634.60 
      1.00:    -642.41 



 --> STEP: 19


     10.00:    -610.05 
      4.64:    -634.60 |
      2.15:    -642.05 |
      1.00:    -650.34 



 --> STEP: 20


     10.00:    -629.25 
      4.64:    -634.60 
      2.15:    -648.44 
      1.00:    -650.34 



 --> STEP: 21


     10.00:    -588.97 
      4.64:    -630.98 
      2.15:    -647.70 
      1.00:    -650.34 



 --> STEP: 22


     10.00:    -593.01 
      4.64:    -630.98 
      2.15:    -650.34 |
      1.00:    -650.24 |



 --> STEP: 23


     10.00:    -562.20 
      4.64:    -630.98 
      2.15:    -650.34 
      1.00:    -650.24 



 --> STEP: 24


     10.00:    -598.57 
      4.64:    -632.12 
      2.15:    -650.24 |
      1.00:    -655.92 |



 --> STEP: 25


     10.00:    -608.13 
      4.64:    -621.94 
      2.15:    -650.24 
      1.00:    -655.92 



 --> STEP: 26


     10.00:    -600.09 
      4.64:    -631.78 
      2.15:    -650.69 
      1.00:    -655.92 



 --> STEP: 27


     10.00:    -583.12 
      4.64:    -628.96 
      2.15:    -647.21 
      1.00:    -655.92 



 --> STEP: 28


     10.00:    -590.07 
      4.64:    -621.39 
      2.15:    -652.84 
      1.00:    -662.72 



 --> STEP: 29


     10.00:    -570.40 
      4.64:    -607.01 
      2.15:    -662.39 
      1.00:    -662.72 



 --> STEP: 30


     10.00:    -574.69 
      4.64:    -624.92 
      2.15:    -662.72 |
      1.00:    -662.39 |



 --> STEP: 31


     10.00:    -588.05 
      4.64:    -634.94 
      2.15:    -662.72 
      1.00:    -662.39 



 --> STEP: 32


     10.00:    -575.51 
      4.64:    -624.50 
      2.15:    -662.39 |
      1.00:    -662.72 |



 --> STEP: 33


     10.00:    -630.21 
      4.64:    -631.78 
      2.15:    -662.39 
      1.00:    -662.72 



 --> STEP: 34


     10.00:    -586.90 
      4.64:    -630.44 
      2.15:    -662.72 |
      1.00:    -662.61 |



 --> STEP: 35


     10.00:    -559.48 
      4.64:    -630.44 
      2.15:    -662.72 
      1.00:    -662.78 



 --> STEP: 36


     10.00:    -577.42 
      4.64:    -623.77 
      2.15:    -662.78 |
      1.00:    -662.72 |



 --> STEP: 37


     10.00:    -552.06 
      4.64:    -616.18 
      2.15:    -662.39 
      1.00:    -662.72 



 --> STEP: 38


     10.00:    -580.71 
      4.64:    -643.00 
      2.15:    -662.72 |
      1.00:    -662.39 |



 --> STEP: 39


     10.00:    -600.10 
      4.64:    -643.63 
      2.15:    -662.72 
      1.00:    -662.39 



 --> STEP: 40


     10.00:    -580.44 
      4.64:    -645.42 
      2.15:    -662.72 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 41


     10.00:    -583.13 
      4.64:    -644.67 
      2.15:    -662.72 
      1.00:    -666.86 



 --> STEP: 42


     10.00:    -611.44 
      4.64:    -639.56 
      2.15:    -662.72 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 43


     10.00:    -596.05 
      4.64:    -630.71 
      2.15:    -662.72 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 44


     10.00:    -640.76 |
      4.64:    -637.60 |
      2.15:    -666.23 |
      1.00:    -662.72 |



 --> STEP: 45


     10.00:    -613.58 
      4.64:    -640.89 
      2.15:    -666.23 
      1.00:    -662.72 



 --> STEP: 46


     10.00:    -609.73 
      4.64:    -634.26 
      2.15:    -662.72 |
      1.00:    -666.23 |



 --> STEP: 47


     10.00:    -599.00 
      4.64:    -637.25 
      2.15:    -662.72 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 48


     10.00:    -616.06 
      4.64:    -645.48 
      2.15:    -662.72 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 49


     10.00:    -619.03 
      4.64:    -640.04 
      2.15:    -662.72 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 50


     10.00:    -623.79 
      4.64:    -640.04 
      2.15:    -666.23 |
      1.00:    -662.72 |



 --> STEP: 51


     10.00:    -617.80 
      4.64:    -645.64 
      2.15:    -666.23 
      1.00:    -662.72 



 --> STEP: 52


     10.00:    -601.55 
      4.64:    -644.82 
      2.15:    -662.72 |
      1.00:    -666.23 |



 --> STEP: 53


     10.00:    -625.83 
      4.64:    -644.82 
      2.15:    -662.72 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 54


     10.00:    -580.51 
      4.64:    -646.99 
      2.15:    -662.72 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 55


     10.00:    -623.83 
      4.64:    -648.00 
      2.15:    -656.94 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 56


     10.00:    -630.16 
      4.64:    -648.00 
      2.15:    -656.94 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 57


     10.00:    -639.10 
      4.64:    -643.55 
      2.15:    -656.94 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 58


     10.00:    -638.04 
      4.64:    -642.65 
      2.15:    -656.94 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 59


     10.00:    -642.55 
      4.64:    -642.65 
      2.15:    -656.94 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 60


     10.00:    -618.24 |
      4.64:    -645.42 |
      2.15:    -659.90 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 61


     10.00:    -584.89 
      4.64:    -644.84 
      2.15:    -656.94 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 62


     10.00:    -588.62 
      4.64:    -645.71 
      2.15:    -656.94 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 63


     10.00:    -551.72 
      4.64:    -646.27 
      2.15:    -656.94 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 64


     10.00:    -606.39 
      4.64:    -643.56 
      2.15:    -656.94 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 65


     10.00:    -622.55 
      4.64:    -650.58 
      2.15:    -657.56 
      1.00:    -666.86 



 --> STEP: 66


     10.00:    -637.54 
      4.64:    -650.34 
      2.15:    -657.56 
      1.00:    -666.86 



 --> STEP: 67


     10.00:    -627.95 
      4.64:    -646.69 
      2.15:    -656.94 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 68


     10.00:    -606.11 
      4.64:    -639.78 
      2.15:    -656.94 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 69


     10.00:    -587.77 
      4.64:    -611.35 
      2.15:    -656.94 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 70


     10.00:    -548.36 
      4.64:    -656.94 
      2.15:    -656.94 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 71


     10.00:    -621.27 
      4.64:    -636.19 
      2.15:    -656.94 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 72


     10.00:    -544.33 
      4.64:    -632.82 
      2.15:    -656.94 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 73


     10.00:    -531.78 
      4.64:    -635.30 
      2.15:    -656.94 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 74


     10.00:    -562.34 
      4.64:    -635.30 
      2.15:    -662.72 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 75


     10.00:    -509.44 
      4.64:    -632.87 
      2.15:    -662.72 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 76


     10.00:    -597.64 
      4.64:    -623.53 
      2.15:    -662.72 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 77


     10.00:    -577.36 
      4.64:    -637.26 
      2.15:    -646.61 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 78


     10.00:    -541.63 
      4.64:    -618.85 
      2.15:    -655.41 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 79


     10.00:    -521.97 
      4.64:    -641.52 
      2.15:    -655.41 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 80


     10.00:    -512.63 
      4.64:    -610.93 
      2.15:    -656.66 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 81


     10.00:    -565.76 
      4.64:    -610.45 
      2.15:    -656.66 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 82


     10.00:    -596.93 
      4.64:    -609.50 
      2.15:    -656.66 
      1.00:    -668.04 



 --> STEP: 83


     10.00:    -585.92 
      4.64:    -606.54 
      2.15:    -656.54 
      1.00:    -666.23 



 --> STEP: 84


     10.00:    -580.85 
      4.64:    -618.22 
      2.15:    -660.16 |
      1.00:    -659.68 |



 --> STEP: 85


     10.00:    -584.60 
      4.64:    -616.23 
      2.15:    -660.16 
      1.00:    -659.68 



 --> STEP: 86


     10.00:    -578.38 
      4.64:    -602.60 
      2.15:    -659.56 |
      1.00:    -659.89 |



 --> STEP: 87


     10.00:    -566.71 
      4.64:    -602.36 
      2.15:    -659.56 
      1.00:    -659.89 



 --> STEP: 88


     10.00:    -584.00 
      4.64:    -585.04 
      2.15:    -659.89 |
      1.00:    -659.56 |



 --> STEP: 89


     10.00:    -556.25 
      4.64:    -617.31 
      2.15:    -659.83 
      1.00:    -659.56 



 --> STEP: 90


     10.00:    -591.74 
      4.64:    -635.26 
      2.15:    -655.36 
      1.00:    -659.56 



 --> STEP: 91


     10.00:    -536.37 
      4.64:    -630.10 
      2.15:    -656.31 
      1.00:    -659.95 



 --> STEP: 92


     10.00:    -587.75 
      4.64:    -615.37 
      2.15:    -656.31 
      1.00:    -659.95 



 --> STEP: 93


     10.00:    -577.72 
      4.64:    -622.83 
      2.15:    -653.96 
      1.00:    -659.95 



 --> STEP: 94


     10.00:    -545.06 
      4.64:    -605.42 
      2.15:    -653.96 
      1.00:    -659.95 



 --> STEP: 95


     10.00:    -583.76 
      4.64:    -628.02 
      2.15:    -653.96 
      1.00:    -659.95 



 --> STEP: 96


     10.00:    -526.29 
      4.64:    -628.02 
      2.15:    -653.96 
      1.00:    -659.95 



 --> STEP: 97


     10.00:    -533.63 
      4.64:    -616.68 
      2.15:    -653.79 
      1.00:    -659.95 



 --> STEP: 98


     10.00:    -527.79 
      4.64:    -608.25 
      2.15:    -656.02 
      1.00:    -659.95 



 --> STEP: 99


     10.00:    -533.52 
      4.64:    -598.58 
      2.15:    -656.02 
      1.00:    -659.95 



 --> STEP: 100


     10.00:    -522.70 
      4.64:    -611.99 
      2.15:    -648.93 
      1.00:    -660.07 



 --> Clustering best 4000 decoys 
       0% |                                                    | ETA:  --:--:--
       1% |                                                    | ETA:  00:11:43
       2% |#                                                   | ETA:  00:13:02
       3% |#                                                   | ETA:  00:12:38
       4% |##                                                  | ETA:  00:12:23
       5% |##                                                  | ETA:  00:12:17
       6% |###                                                 | ETA:  00:12:10
       7% |###                                                 | ETA:  00:11:54
       8% |####                                                | ETA:  00:11:40
       9% |####                                                | ETA:  00:11:47
      10% |#####                                               | ETA:  00:11:30
      11% |#####                                               | ETA:  00:11:29
      12% |######                                              | ETA:  00:11:17
      13% |######                                              | ETA:  00:11:08
      14% |#######                                             | ETA:  00:11:00
      15% |#######                                             | ETA:  00:10:51
      16% |########                                            | ETA:  00:10:43
      17% |########                                            | ETA:  00:10:35
      18% |#########                                           | ETA:  00:10:29
      19% |#########                                           | ETA:  00:10:20
      20% |##########                                          | ETA:  00:10:10
      21% |##########                                          | ETA:  00:10:04
      22% |###########                                         | ETA:  00:09:58
      23% |###########                                         | ETA:  00:09:53
      24% |############                                        | ETA:  00:09:44
      25% |#############                                       | ETA:  00:09:36
      26% |#############                                       | ETA:  00:09:29
      27% |##############                                      | ETA:  00:09:22
      28% |##############                                      | ETA:  00:09:17
      29% |###############                                     | ETA:  00:09:10
      30% |###############                                     | ETA:  00:09:04
      31% |################                                    | ETA:  00:08:56
      32% |################                                    | ETA:  00:08:48
      33% |#################                                   | ETA:  00:08:40
      34% |#################                                   | ETA:  00:08:30
      35% |##################                                  | ETA:  00:08:22
      36% |##################                                  | ETA:  00:08:14
      37% |###################                                 | ETA:  00:08:07
      38% |###################                                 | ETA:  00:08:00
      39% |####################                                | ETA:  00:07:52
      40% |####################                                | ETA:  00:07:43
      41% |#####################                               | ETA:  00:07:35
      42% |#####################                               | ETA:  00:07:28
      43% |######################                              | ETA:  00:07:20
      44% |######################                              | ETA:  00:07:12
      45% |#######################                             | ETA:  00:07:04
      46% |#######################                             | ETA:  00:06:56
      47% |########################                            | ETA:  00:06:48
      48% |########################                            | ETA:  00:06:40
      49% |#########################                           | ETA:  00:06:32
      50% |##########################                          | ETA:  00:06:25
      51% |##########################                          | ETA:  00:06:16
      52% |###########################                         | ETA:  00:06:08
      53% |###########################                         | ETA:  00:06:01
      54% |############################                        | ETA:  00:05:53
      55% |############################                        | ETA:  00:05:45
      56% |#############################                       | ETA:  00:05:38
      57% |#############################                       | ETA:  00:05:30
      58% |##############################                      | ETA:  00:05:23
      59% |##############################                      | ETA:  00:05:15
      60% |###############################                     | ETA:  00:05:07
      61% |###############################                     | ETA:  00:05:00
      62% |################################                    | ETA:  00:04:52
      63% |################################                    | ETA:  00:04:45
      64% |#################################                   | ETA:  00:04:37
      65% |#################################                   | ETA:  00:04:29
      66% |##################################                  | ETA:  00:04:22
      67% |##################################                  | ETA:  00:04:15
      68% |###################################                 | ETA:  00:04:07
      69% |###################################                 | ETA:  00:04:00
      70% |####################################                | ETA:  00:03:52
      71% |####################################                | ETA:  00:03:45
      72% |#####################################               | ETA:  00:03:37
      73% |#####################################               | ETA:  00:03:29
      74% |######################################              | ETA:  00:03:21
      75% |#######################################             | ETA:  00:03:13
      76% |#######################################             | ETA:  00:03:05
      77% |########################################            | ETA:  00:02:58
      78% |########################################            | ETA:  00:02:50
      79% |#########################################           | ETA:  00:02:42
      80% |#########################################           | ETA:  00:02:35
      81% |##########################################          | ETA:  00:02:27
      82% |##########################################          | ETA:  00:02:19
      83% |###########################################         | ETA:  00:02:11
      84% |###########################################         | ETA:  00:02:04
      85% |############################################        | ETA:  00:01:56
      86% |############################################        | ETA:  00:01:48
      87% |#############################################       | ETA:  00:01:40
      88% |#############################################       | ETA:  00:01:32
      89% |##############################################      | ETA:  00:01:25
      90% |##############################################      | ETA:  00:01:17
      91% |###############################################     | ETA:  00:01:09
      92% |###############################################     | ETA:  00:01:02
      93% |################################################    | ETA:  00:00:54
      94% |################################################    | ETA:  00:00:46
      95% |#################################################   | ETA:  00:00:38
      96% |#################################################   | ETA:  00:00:30
      97% |##################################################  | ETA:  00:00:23
      98% |##################################################  | ETA:  00:00:15
      99% |################################################### | ETA:  00:00:07
     100% |####################################################| Time: 00:12:55

 --> Clustering stats
       idx      size    e_mean     e_std
         1      4000   -666.32      0.32

 --> Saving PDB files with cluster representatives:
     rms_input_fa/clust_00001.pdb



 --> Annealing the final model
       0% |                                                    | ETA:  --:--:--
       1% |                                                    | ETA:  00:00:21
       2% |#                                                   | ETA:  00:00:20
       3% |#                                                   | ETA:  00:00:20
       4% |##                                                  | ETA:  00:00:18
       5% |##                                                  | ETA:  00:00:18
       6% |###                                                 | ETA:  00:00:17
       7% |###                                                 | ETA:  00:00:16
       8% |####                                                | ETA:  00:00:16
       9% |####                                                | ETA:  00:00:15
      10% |#####                                               | ETA:  00:00:16
      11% |#####                                               | ETA:  00:00:16
      12% |######                                              | ETA:  00:00:16
      13% |######                                              | ETA:  00:00:16
      14% |#######                                             | ETA:  00:00:17
      15% |#######                                             | ETA:  00:00:18
      16% |########                                            | ETA:  00:00:19
      17% |########                                            | ETA:  00:00:19
      18% |#########                                           | ETA:  00:00:19
      19% |#########                                           | ETA:  00:00:19
      20% |##########                                          | ETA:  00:00:19
      21% |##########                                          | ETA:  00:00:19
      22% |###########                                         | ETA:  00:00:19
      23% |###########                                         | ETA:  00:00:18
      24% |############                                        | ETA:  00:00:18
      25% |#############                                       | ETA:  00:00:18
      26% |#############                                       | ETA:  00:00:17
      27% |##############                                      | ETA:  00:00:17
      28% |##############                                      | ETA:  00:00:17
      29% |###############                                     | ETA:  00:00:17
      30% |###############                                     | ETA:  00:00:17
      31% |################                                    | ETA:  00:00:16
      32% |################                                    | ETA:  00:00:16
      33% |#################                                   | ETA:  00:00:16
      34% |#################                                   | ETA:  00:00:16
      35% |##################                                  | ETA:  00:00:16
      36% |##################                                  | ETA:  00:00:16
      37% |###################                                 | ETA:  00:00:16
      38% |###################                                 | ETA:  00:00:16
      39% |####################                                | ETA:  00:00:15
      40% |####################                                | ETA:  00:00:15
      41% |#####################                               | ETA:  00:00:15
      42% |#####################                               | ETA:  00:00:14
      43% |######################                              | ETA:  00:00:14
      44% |######################                              | ETA:  00:00:14
      45% |#######################                             | ETA:  00:00:14
      46% |#######################                             | ETA:  00:00:14
      47% |########################                            | ETA:  00:00:13
      48% |########################                            | ETA:  00:00:13
      49% |#########################                           | ETA:  00:00:13
      50% |##########################                          | ETA:  00:00:12
      51% |##########################                          | ETA:  00:00:12
      52% |###########################                         | ETA:  00:00:12
      53% |###########################                         | ETA:  00:00:12
      54% |############################                        | ETA:  00:00:11
      55% |############################                        | ETA:  00:00:11
      56% |#############################                       | ETA:  00:00:11
      57% |#############################                       | ETA:  00:00:11
      58% |##############################                      | ETA:  00:00:11
      59% |##############################                      | ETA:  00:00:10
      60% |###############################                     | ETA:  00:00:10
      61% |###############################                     | ETA:  00:00:10
      62% |################################                    | ETA:  00:00:10
      63% |################################                    | ETA:  00:00:09
      64% |#################################                   | ETA:  00:00:09
      65% |#################################                   | ETA:  00:00:09
      66% |##################################                  | ETA:  00:00:09
      67% |##################################                  | ETA:  00:00:08
      68% |###################################                 | ETA:  00:00:08
      69% |###################################                 | ETA:  00:00:08
      70% |####################################                | ETA:  00:00:08
      71% |####################################                | ETA:  00:00:07
      72% |#####################################               | ETA:  00:00:07
      73% |#####################################               | ETA:  00:00:07
      74% |######################################              | ETA:  00:00:06
      75% |#######################################             | ETA:  00:00:06
      76% |#######################################             | ETA:  00:00:06
      77% |########################################            | ETA:  00:00:06
      78% |########################################            | ETA:  00:00:06
      79% |#########################################           | ETA:  00:00:05
      80% |#########################################           | ETA:  00:00:05
      81% |##########################################          | ETA:  00:00:05
      82% |##########################################          | ETA:  00:00:04
      83% |###########################################         | ETA:  00:00:04
      84% |###########################################         | ETA:  00:00:04
      85% |############################################        | ETA:  00:00:04
      86% |############################################        | ETA:  00:00:03
      87% |#############################################       | ETA:  00:00:03
      88% |#############################################       | ETA:  00:00:03
      89% |##############################################      | ETA:  00:00:03
      90% |##############################################      | ETA:  00:00:02
      91% |###############################################     | ETA:  00:00:02
      92% |###############################################     | ETA:  00:00:02
      93% |################################################    | ETA:  00:00:01
      94% |################################################    | ETA:  00:00:01
      95% |#################################################   | ETA:  00:00:01
      96% |#################################################   | ETA:  00:00:01
      97% |##################################################  | ETA:  00:00:00
      98% |##################################################  | ETA:  00:00:00
      99% |################################################### | ETA:  00:00:00
     100% |####################################################| Time: 00:00:27

 ==> Wrote final model: rms_input_fa/final_model_refined.pdb


     Elapsed time 00:59:52
 ==> Time finished 06/01/2020, 16:37:56

Normal termination of RNA Masonry
