pdbe.org/5wis

Title

Crystal structure of the Thermus thermophilus 70S ribosome in complex with methymycin and bound to mRNA and A-, P- and E-site tRNAs at 2.7A resolution

Authors

Almutairi, M.M., Svetlov, M.S., Hansen, D.A., Khabibullina, N.F., Klepacki, D., Kang, H.Y., Sherman, D.H., Vazquez-Laslop, N., Polikanov, Y.S., Mankin, A.S.

Release date

2018-02-14

Keywords

macrolide, antibiotic, inhibitor, inhibition of translation, peptidyl transferase center, RIBOSOME

Experimental Method

X-RAY DIFFRACTION

Maximum resolution

2.7Å

Quality scores

RNA chains (Rfam)

• 1a :
• SSU_rRNA_bacteria
• 1A :
• PK-G12rRNA
• 1B :
• 5S_rRNA
• 1v :
• None
• 1w :
• None
• 1x :
• tRNA
• 1y :
• None
• 2a :
• SSU_rRNA_bacteria
• 2A :
• PK-G12rRNA
• 2B :
• 5S_rRNA
• 2v :
• None
• 2w :
• None
• 2x :
• tRNA
• 2y :
• None

Protein chains (Uniprot)

• 10 :
• P60493
• 11 :
• P60494
• 12 :
• Q5SHP6
• 13 :
• Q5SHQ6
• 14 :
• Q5SJE1
• 15 :
• P80339
• 16 :
• P35871
• 17 :
• P80340
• 18 :
• P80341
• 19 :
• Q5SHR2
• 1b :
• P80371
• 1c :
• P80372
• 1D :
• None
• 1d :
• None
• 1E :
• None
• 1e :
• None
• 1F :
• None
• 1f :
• None
• 1G :
• None
• 1g :
• None
• 1H :
• None
• 1h :
• None
• 1I :
• None
• 1i :
• None
• 1j :
• Q5SHN7
• 1k :
• P80376
• 1l :
• Q5SHN3
• 1m :
• P80377
• 1N :
• None
• 1n :
• None
• 1O :
• None
• 1o :
• None
• 1P :
• None
• 1p :
• None
• 1Q :
• None
• 1q :
• None
• 1R :
• None
• 1r :
• None
• 1S :
• None
• 1s :
• None
• 1T :
• None
• 1t :
• None
• 1U :
• None
• 1u :
• None
• 1V :
• P60492
• 1W :
• Q5SHP3
• 1X :
• Q5SHP0
• 1Y :
• Q5SHP9
• 1Z :
• Q5SHZ1
• 20 :
• P60493
• 21 :
• P60494
• 22 :
• Q5SHP6
• 23 :
• Q5SHQ6
• 24 :
• Q5SJE1
• 25 :
• P80339
• 26 :
• P35871
• 27 :
• P80340
• 28 :
• P80341
• 29 :
• Q5SHR2
• 2b :
• P80371
• 2c :
• P80372
• 2D :
• None
• 2d :
• None
• 2E :
• None
• 2e :
• None
• 2F :
• None
• 2f :
• None
• 2G :
• None
• 2g :
• None
• 2H :
• None
• 2h :
• None
• 2I :
• None
• 2i :
• None
• 2j :
• Q5SHN7
• 2k :
• P80376
• 2l :
• Q5SHN3
• 2m :
• P80377
• 2N :
• None
• 2n :
• None
• 2O :
• None
• 2o :
• None
• 2P :
• None
• 2p :
• None
• 2Q :
• None
• 2q :
• None
• 2R :
• None
• 2r :
• None
• 2S :
• None
• 2s :
• None
• 2T :
• None
• 2t :
• None
• 2U :
• None
• 2u :
• None
• 2V :
• P60492
• 2W :
• Q5SHP3
• 2X :
• Q5SHP0
• 2Y :
• Q5SHP9
• 2Z :
• Q5SHZ1